Index

_

__find_psp_dir() (sparc.io.SparcBundle method) _find_files() (sparc.io.SparcBundle method) _make_label() (sparc.io.SparcBundle method)

_make_singlepoint() (sparc.io.SparcBundle method) _read_ion_and_inpt() (sparc.io.SparcBundle method) _write_ion_and_inpt() (sparc.io.SparcBundle method)

A

ApiTest (class in sparc.quicktest) ase_objtype (sparc.calculator.SPARC attribute)

atoms_bc_to_sparc() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) atoms_dict() (sparc.calculator.SPARC method) atoms_to_dict() (in module sparc.sparc_parsers.atoms)

B

BaseTest (class in sparc.quicktest)

bisect_and_strip() (in module sparc.sparc_parsers.utils)

C

calculate() (sparc.calculator.SPARC method) (sparc.socketio.SPARCSocketClient method) calculate_new_protocol() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) (sparc.socketio.SPARCSocketServer method) calculate_origin_protocol() (sparc.socketio.SPARCSocketServer method) categories (sparc.api.SparcAPI attribute) check_input_atoms() (sparc.calculator.SPARC method) check_state() (sparc.calculator.SPARC method) checksum_all() (in module sparc.download_data) close() (sparc.calculator.SPARC method) CommandTest (class in sparc.quicktest) compare_dict() (in module sparc.utils)

concatinate_output() (sparc.calculator.SPARC method) constraints_from_relax() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) contain_only_bool() (in module sparc.docparser) convert_comment() (in module sparc.docparser) convert_string_to_value() (sparc.api.SparcAPI method), [1] convert_tex_default() (in module sparc.docparser) convert_tex_example() (in module sparc.docparser) convert_tex_parameter() (in module sparc.docparser) convert_to_ase() (sparc.io.SparcBundle method), [1] convert_value_to_string() (sparc.api.SparcAPI method), [1] copy_psp_file() (in module sparc.sparc_parsers.pseudopotential) count_symbols() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) cprint() (in module sparc.utils)

D

data_types (sparc.api.SparcAPI attribute) default_params (sparc.calculator.SPARC attribute) deprecated() (in module sparc.utils) detect_socket_compatibility() (sparc.calculator.SPARC method) detect_sparc_version() (sparc.calculator.SPARC method) dict_atoms() (sparc.calculator.SPARC method) dict_to_atoms() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) directory (sparc.calculator.SPARC property) (sparc.io.SparcBundle attribute)

dislay_name (sparc.quicktest.BaseTest property) display_docstring() (sparc.quicktest.BaseTest method) display_name (sparc.quicktest.ApiTest attribute) (sparc.quicktest.CommandTest attribute) (sparc.quicktest.FileIOCalcTest attribute) (sparc.quicktest.ImportTest attribute) (sparc.quicktest.PspTest attribute) (sparc.quicktest.SocketCalcTest attribute) download_psp() (in module sparc.download_data)

E

ensure_socket() (sparc.calculator.SPARC method)

estimate_memory() (sparc.calculator.SPARC method) execute() (sparc.calculator.SPARC method)

F

FileIOCalcTest (class in sparc.quicktest)

find_main_file() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1] find_pseudo_path() (in module sparc.sparc_parsers.pseudopotential)

G

generate_command() (sparc.calculator.SPARC method) generate_random_socket_name() (in module sparc.socketio) get_fermi_level() (sparc.calculator.SPARC method) get_geometric_steps() (sparc.calculator.SPARC method) get_include_files() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1] get_label() (in module sparc.sparc_parsers.utils)

get_nstates() (sparc.calculator.SPARC method) get_parameter_dict() (sparc.api.SparcAPI method), [1] get_pseudopotential_directory() (sparc.calculator.SPARC method) get_runtime() (sparc.calculator.SPARC method) get_scf_steps() (sparc.calculator.SPARC method) get_stress() (sparc.calculator.SPARC method)

H

h2gpts() (in module sparc.utils)

help_info() (sparc.api.SparcAPI method), [1]

I

implemented_properties (sparc.calculator.SPARC attribute) ImportTest (class in sparc.quicktest) in_socket_filename (sparc.calculator.SPARC property) infer_pseudo_path() (in module sparc.sparc_parsers.pseudopotential) init_atoms (sparc.io.SparcBundle attribute) init_inputs (sparc.io.SparcBundle attribute) interpret_downsampling_input() (sparc.calculator.SPARC method)

interpret_grid_input() (sparc.calculator.SPARC method) interpret_kpoint_input() (sparc.calculator.SPARC method) interpret_kpoint_shift() (sparc.calculator.SPARC method) InvalidSortingComment irun() (sparc.socketio.SPARCSocketClient method) is_array() (in module sparc.docparser) is_psp_download_complete() (in module sparc.download_data)

J

json_from_directory() (sparc.docparser.SparcDocParser class method) (sparc.docparser.SparcDocParser method)

json_from_repo() (sparc.docparser.SparcDocParser class method) (sparc.docparser.SparcDocParser method)

L

label (sparc.calculator.SPARC property) (sparc.io.SparcBundle attribute)

last_image (sparc.io.SparcBundle attribute) locate_api() (in module sparc.utils) log (sparc.calculator.SPARC property)

M

main() (in module sparc.cli) (in module sparc.client) (in module sparc.quicktest) make_reverse_mapping() (in module sparc.sparc_parsers.utils) make_test() (sparc.quicktest.ApiTest method) (sparc.quicktest.BaseTest method) (sparc.quicktest.CommandTest method) (sparc.quicktest.FileIOCalcTest method) (sparc.quicktest.ImportTest method) (sparc.quicktest.PspTest method) (sparc.quicktest.SocketCalcTest method) mode (sparc.io.SparcBundle attribute) modify_atoms_bc() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) module sparc sparc.api sparc.calculator sparc.cli sparc.client sparc.common sparc.docparser sparc.download_data sparc.io sparc.quicktest sparc.socketio sparc.sparc_parsers sparc.sparc_parsers.aimd sparc.sparc_parsers.atoms sparc.sparc_parsers.geopt sparc.sparc_parsers.inpt sparc.sparc_parsers.ion sparc.sparc_parsers.out sparc.sparc_parsers.pseudopotential sparc.sparc_parsers.static sparc.sparc_parsers.utils sparc.utils

monitor_process() (in module sparc.utils) MultiplePseudoPotentialFiles

N

name (sparc.calculator.SPARC attribute)

NoMatchingPseudopotential NotPSP8Format

O

other_parameters (sparc.api.SparcAPI attribute) (sparc.docparser.SparcDocParser attribute)

P

parameter_categories (sparc.docparser.SparcDocParser attribute) parameters (sparc.api.SparcAPI attribute) (sparc.docparser.SparcDocParser attribute) parse_input_args() (sparc.calculator.SPARC method) parse_MD() (sparc.calculator.SPARC method) parse_output() (sparc.calculator.SPARC method) parse_parameters() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1] parse_psp8_header() (in module sparc.sparc_parsers.pseudopotential) parse_relax() (sparc.calculator.SPARC method)

parse_version() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1] pid (sparc.calculator.SPARC property) postprocess() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1] print_sysinfo() (sparc.calculator.SPARC method) proc (sparc.socketio.SPARCSocketServer property) ProcessReturned psp_data (sparc.io.SparcBundle attribute) psp_dir (sparc.io.SparcBundle attribute) psp_env (sparc.io.SparcBundle attribute) PspTest (class in sparc.quicktest)

R

raw_results (sparc.calculator.SPARC property) (sparc.io.SparcBundle attribute) read_block_input() (in module sparc.sparc_parsers.utils) read_line() (sparc.calculator.SPARC method) read_psp_info() (sparc.io.SparcBundle method), [1] read_raw_results() (sparc.io.SparcBundle method), [1] read_results() (sparc.calculator.SPARC method) read_sparc() (in module sparc.io) recover_index_order_from_ion_file() (sparc.calculator.SPARC method)

recv_object() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) recvinit() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) relax_from_all_constraints() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) relax_from_constraint() (in module sparc.sparc_parsers.atoms) resort (sparc.calculator.SPARC property) (sparc.io.SparcBundle property) run() (sparc.socketio.SPARCSocketClient method) run_client() (sparc.calculator.SPARC method) run_test() (sparc.quicktest.BaseTest method)

S

sanitize_default() (in module sparc.docparser) sanitize_description() (in module sparc.docparser) sanitize_path() (in module sparc.utils) sanitize_type() (in module sparc.docparser) send_atoms_and_params() (sparc.socketio.SPARCSocketServer method) send_object() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) send_param() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) send_string() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) sendinit() (sparc.socketio.SPARCProtocol method) set() (sparc.calculator.SPARC method) setup_parallel_env() (sparc.calculator.SPARC method) socket_filename (sparc.socketio.SPARCSocketServer property) socket_mode (sparc.calculator.SPARC property) SocketCalcTest (class in sparc.quicktest) sort (sparc.calculator.SPARC property) (sparc.io.SparcBundle property) sorting (sparc.io.SparcBundle attribute) sparc module SPARC (class in sparc.calculator) sparc.api module sparc.calculator module sparc.cli module sparc.client module sparc.common module sparc.docparser module sparc.download_data module sparc.io module sparc.quicktest module

sparc.socketio module sparc.sparc_parsers module sparc.sparc_parsers.aimd module sparc.sparc_parsers.atoms module sparc.sparc_parsers.geopt module sparc.sparc_parsers.inpt module sparc.sparc_parsers.ion module sparc.sparc_parsers.out module sparc.sparc_parsers.pseudopotential module sparc.sparc_parsers.static module sparc.sparc_parsers.utils module sparc.utils module sparc_version (sparc.api.SparcAPI attribute) SparcAPI (class in sparc.api) SparcBundle (class in sparc.io) SparcDocParser (class in sparc.docparser) SPARCMissingDeps (class in sparc) SPARCProtocol (class in sparc.socketio) SPARCSocketClient (class in sparc.socketio) SPARCSocketServer (class in sparc.socketio) special_inputs (sparc.calculator.SPARC attribute) split_socket_name() (in module sparc.client) string2index() (in module sparc.utils) strip_comments() (in module sparc.sparc_parsers.utils)

T

text2value() (in module sparc.docparser) time_limit() (in module sparc.utils)

TimeoutException to_dict() (sparc.docparser.SparcDocParser method), [1]

U

use_socket (sparc.calculator.SPARC property)

V

validate_input() (sparc.api.SparcAPI method), [1]

validator (sparc.io.SparcBundle attribute) version (sparc.docparser.SparcDocParser attribute)

W

write_input() (sparc.calculator.SPARC method)

write_sparc() (in module sparc.io)